|
|
Significance, occurrence and determinants of horizontally transmissible colistin resistance in Gram negative bacteria
Kislíková, Karolína ; Skoumalová, Petra (oponent) ; Márová, Ivana (vedoucí práce)
Colistin, also known as polymyxin E, is antibiotics active against most of Gram-negative bacteria. In the pas decade, emergency of multidrug-resistant bacteria led to increase of colistin administration as a last resort antibiotic for human infections. The first plasmid-mediated colistin resistance gene mcr-1 was identified in 2015 in animals in China and after first detection, additional mcr genes: mcr-2, mcr-3, mcr-4, mcr-5, mcr-6, mcr-7 a mcr-8 were described throughout the world. The aim of this thesis was to clarify whether there is horizontal transmission colistin resistance encoded by the mcr genes in gram-negative bacteria isolated from the environment, animals and their breeding and food. The mcr-1 gene was detected in 2 strains Escherichia coli isolated from waste water. The mcr-4 gene was detected in 1 strain Shewanella putrefaciens isolate obtained from the lake. The environment is the most important source and way of spreading this type of resistance in the Czech Republic.
|
|
|
Antimikrobiální rezistence u klinických izolátů Clostridioides difficile od hospitalizovaných pacientů v České a Slovenské republice.
Zíková, Jaroslava ; Krůtová, Marcela (vedoucí práce) ; Najmanová, Lucie (oponent)
Clostridioides difficile je jedním z nejčastějších původců kolitid (CDI) spojených s nemocniční péčí. V posledních letech však dochází k rostoucímu počtu hlášených i případů v komunitě. Typizace vyvolávajících kmenů nám umožňuje sledovat výskyt a šíření určitých typů C. difficile (CDI). S cílem aktualizovat data o současné epidemiologické situaci CDI bylo z 23 českých (n=200) a ze 17 slovenských (n=142) nemocnic v období od října do listopadu roku 2021 zasláno 342 izolátů C. difficile nebo vzorků stolic od pacientů s CDI, které byly následně kultivovány. Všechny izoláty C. difficile byly charakterizovány PCR ribotypizací a detekcí genů pro tvorbu toxinů. Z 342 izolátů bylo identifikováno 52 různých ribotypizačních profilů. Nejčastěji detekovanými ribotypy byly 001, 176, 014, 018 a 020. U všech ribotypů byly nalezeny geny pro produkci toxinů A a B. Geny pro binární toxin byly detekovány u 43 (21,5 %) českých izolátů a u 117 (82,4 %) slovenských izolátů. U vybraných izolátů (n=140, 40,9 %) bylo provedeno celogenomové sekvenování (WGS) a testování antimikrobiální citlivosti k 17 antibiotikům (E-test). Pomocí multilokusové sekvenační typizace (7 konzervovaných genů) bylo určeno 30 různých sekvenčních typů z 39 zahrnutých ribotypů. Všechny izoláty C. difficile byly citlivé k vankomycinu, k tetracyklinu,...
|
|
|
Detailní analýza genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií
Vancová, Kateřina ; Schwarzerová, Jana (oponent) ; Čejková, Darina (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detailní analýzou genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií. Antimikrobiální rezistence (AMR) u bakterií je celosvětově rostoucí hrozbou pro veřejné zdraví. U těchto bakterií jsou geny AMR často spojeny s mobilními genetickými elementy (MGE), které pod- porují jejich mobilitu a umožňují jim rychlé šíření mezi různými bakteriemi. V práci je popsán horizontální přenos genetické informace, problematika antimikrobiální rezistence a databáze pro detekci genů AMR a MGE. Poté byla provedena detekce a analýza genů AMR a MGE u zástupců anaerobních bakterií. Téměr polovina z nich obsahovala alespoň 1 gen AMR, celkem 112 různých genů. Poté bylo detekováno 66 různých MGE, 4 z nich přenášely 6 různých detekovaných genů AMR.
|
|
|
Detailní analýza genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií
Vancová, Kateřina ; Schwarzerová, Jana (oponent) ; Čejková, Darina (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detailní analýzou genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií. Antimikrobiální rezistence (AMR) u bakterií je celosvětově rostoucí hrozbou pro veřejné zdraví. U těchto bakterií jsou geny AMR často spojeny s mobilními genetickými elementy (MGE), které pod- porují jejich mobilitu a umožňují jim rychlé šíření mezi různými bakteriemi. V práci je popsán horizontální přenos genetické informace, problematika antimikrobiální rezistence a databáze pro detekci genů AMR a MGE. Poté byla provedena detekce a analýza genů AMR a MGE u zástupců anaerobních bakterií. Téměr polovina z nich obsahovala alespoň 1 gen AMR, celkem 112 různých genů. Poté bylo detekováno 66 různých MGE, 4 z nich přenášely 6 různých detekovaných genů AMR.
|
|
|
Isolation of Quorum Sensing Inhibitory compounds from cyanobacteria
MACHO, Markéta
Overuse of antibiotics has led to the development of resistance in many medically relevant human pathogens, posing a threat to human health. The recent decline in the discovery of novel antibiotics together with development of multi-antibiotic resistant strains demands a search of an alternative approach. Anti-virulence therapy poses significantly lower pressure on developing resistance given its focus on disarming the pathogen rather than eradicating it. Advancement in the field of bacterial cell-to-cell communication (Quorum Sensing, QS) and its molecular mechanism regulating the production of virulence factors in many clinically relevant human pathogens led to the discovery of Quorum Sensing inhibitory (QSI) molecules. Cyanobacteria are recognized as a prolific source of natural bioactive compounds with great pharmacological potential. The aim of this study was to screen cyanobacterial extracts for QSI activity in search of potential anti-virulence drugs. 45 cyanobacterial strains were randomly selected from the in-house culture collection of Centre Algatech, extracted, and fractionated to generate 1575 fractions for QSI evaluation. Strains 3, 16, and 113 exhibited the highest inhibitory potential against both used biosensors, E. coli pSB401 and E. coli pSB1075. The obtained results open a future prospect to isolate and elucidate the lead molecule responsible for QSI activity.
|
|
|
Spotřeba antibiotik v dětské populaci do 14 let v mezinárodním srovnání
Laštík, Jozef ; Křížová, Eva (vedoucí práce)
Antibiotika jsou nedůležitějším prostředkem, který má společnost v boji proti bakteriálním infekcím. Objev penicilinu Sirem A.Flemingem v roku 1928, jeho izolace Chainem a Floreym v r. 1940 a následné klinické využití způsobily, že do té doby závažné či smrtelné bakteriální infekční onemocnění, jsou dnes léčitelné. V průběhu následujících let vzniklo mnoho dalších antibiotik či chemoterapeutik, které dále rozšířily možnosti léčby mikrobiálních infekcí. Vysoká popularita antibiotik v klinické praxi si v průběhu několika málo desetiletí vyžádala svou daň. Značná spotřeba antimikrobiálních látek a jejich nesprávné užívání vedla ke vzniku bakteriální rezistence, se kterou se při objevu antibiotik nepočítalo. Nežádoucím důsledkem je snížená možnost ve výběru antibiotika při kauzální terapii infekcí. To představuje obrovské riziko pro současnou populaci, ale zejména pro příští generace. Může dokonce dojít až k tomu, že antibiotika dnes používaná ztratí v důsledku bakteriální rezistence účinnost, a nebudeme umět vůbec proti bakteriím bojovat. Jedním z medicínských oborů, kde existuje trvale zvýšená spotřeba antibiotik, je pediatrie. Děti mají omezené imunitní mechanizmy, a proto tvoří populaci, která je vnímavější k infekcím. Nejčastěji trpí dětští pacienti komunitními respiračními infekcemi. Přestože jsou tyto...
|
|
|
Porovnávací analýza izolátů Clostridioides difficile kultivovaných z různých zdrojů.
Eretová, Veronika ; Krůtová, Marcela (vedoucí práce) ; Ježek, Petr (oponent)
Infekce vyvolané Clostridioides difficile (CDI) jsou obecně vnímány jako infekce spojené s nemocniční péčí. V posledních letech však dochází k narůstání jejich incidence i v komunitě. Výskyt C. difficile byl popsán např. u zvířat, v potravinách či prostředí vody a půdy. Cílem této práce bylo charakterizovat kmeny C. difficile získané z různých zdrojů pomocí molekulárně biologických metod. Výsledky jsou diskutovány s dostupnými údaji o českých humánních izolátech C. difficile. V této práci bylo analyzováno celkem 135 izolátů C. difficile kultivovaných ze vzorků prasat (n = 57), telat (n = 44), koní (n = 18), vody (n = 15) a ježka (n = 1). Pomocí PCR ribotypizace bylo identifikováno 22 různých ribotypizačních profilů, nejčastěji detekovanými ribotypy byly 033, 011, 126, 078. Byly nalezeny jak toxigenní i netoxigenní ribotypy, včetně ribotypů nesoucích geny pro produkci binárního toxinu. Nejčastěji zachycené rezistence k antimikrobiálním látkám byly k ciprofloxacinu, klindamycinu a erythromycinu. Všechny detekované ribotypy a sekvenační typy u izolátů ze zvířat a prostředí byly v předchozích projektech nalezeny i u českých humánních izolátů, což potvrzuje roli zvířat a prostředí jako rezervoáru C. difficile. Nicméně epidemické humánní ribotypy 001 a 176, které dominují současné epidemiologické situaci...
|
|
|
Significance, occurrence and determinants of horizontally transmissible colistin resistance in Gram negative bacteria
Kislíková, Karolína ; Skoumalová, Petra (oponent) ; Márová, Ivana (vedoucí práce)
Colistin, also known as polymyxin E, is antibiotics active against most of Gram-negative bacteria. In the pas decade, emergency of multidrug-resistant bacteria led to increase of colistin administration as a last resort antibiotic for human infections. The first plasmid-mediated colistin resistance gene mcr-1 was identified in 2015 in animals in China and after first detection, additional mcr genes: mcr-2, mcr-3, mcr-4, mcr-5, mcr-6, mcr-7 a mcr-8 were described throughout the world. The aim of this thesis was to clarify whether there is horizontal transmission colistin resistance encoded by the mcr genes in gram-negative bacteria isolated from the environment, animals and their breeding and food. The mcr-1 gene was detected in 2 strains Escherichia coli isolated from waste water. The mcr-4 gene was detected in 1 strain Shewanella putrefaciens isolate obtained from the lake. The environment is the most important source and way of spreading this type of resistance in the Czech Republic.
|
|
|
Spotřeba antibiotik v dětské populaci do 14 let v mezinárodním srovnání
Laštík, Jozef ; Křížová, Eva (vedoucí práce)
Antibiotika jsou nedůležitějším prostředkem, který má společnost v boji proti bakteriálním infekcím. Objev penicilinu Sirem A.Flemingem v roku 1928, jeho izolace Chainem a Floreym v r. 1940 a následné klinické využití způsobily, že do té doby závažné či smrtelné bakteriální infekční onemocnění, jsou dnes léčitelné. V průběhu následujících let vzniklo mnoho dalších antibiotik či chemoterapeutik, které dále rozšířily možnosti léčby mikrobiálních infekcí. Vysoká popularita antibiotik v klinické praxi si v průběhu několika málo desetiletí vyžádala svou daň. Značná spotřeba antimikrobiálních látek a jejich nesprávné užívání vedla ke vzniku bakteriální rezistence, se kterou se při objevu antibiotik nepočítalo. Nežádoucím důsledkem je snížená možnost ve výběru antibiotika při kauzální terapii infekcí. To představuje obrovské riziko pro současnou populaci, ale zejména pro příští generace. Může dokonce dojít až k tomu, že antibiotika dnes používaná ztratí v důsledku bakteriální rezistence účinnost, a nebudeme umět vůbec proti bakteriím bojovat. Jedním z medicínských oborů, kde existuje trvale zvýšená spotřeba antibiotik, je pediatrie. Děti mají omezené imunitní mechanizmy, a proto tvoří populaci, která je vnímavější k infekcím. Nejčastěji trpí dětští pacienti komunitními respiračními infekcemi. Přestože jsou tyto...
|
host ::
RSS.